Trans,trans-Farnesyl pyrophosphate ammonium salt ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกของเอนไซม์ โดยเฉพาะเอนไซม์ prenyltransferases ซึ่งมีบทบาทในการปรับแต่งโปรตีนและเส้นทางสัญญาณในเซลล์ สารนี้ทำหน้าที่เป็น substrate ในการสังเคราะห์ไอโซพรีนอยด์ รวมถึงสเตอรอล คาโรทีนอยด์ และเทอร์พีน ทำให้มีคุณค่าต่อการศึกษากลไกเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์ เช่น farnesyltransferase ซึ่งเป็นเป้าหมายในการบำบัดรักษามะเร็ง ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่ซับซ้อนและในการทำความเข้าใจการควบคุมกระบวนการสังเคราะห์คอเลสเตอรอล บทบาทของสารนี้ในกระบวนการสัญญาณเซลล์และการยึดติดโปรตีนกับเมมเบรนทำให้จำเป็นสำหรับการศึกษากระบวนการเซลล์และการแทรกแซงทาง درمانیที่เป็นไปได้