ACAT-IN-3 ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกการเผาผลาญคอเลสเตอรอล โดยทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งที่แรงของเอนไซม์ acyl-CoA:cholesterol acyltransferase (ACAT) ซึ่งมีส่วนเกี่ยวข้องกับการเอสเทอร์ของคอเลสเตอรอลภายในเซลล์ การยับยั้ง ACAT ด้วยสารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถสำรวจบทบาทของการเอสเทอร์คอเลสเตอรอลในกระบวนการทางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาต่างๆ เช่น โรคหลอดเลือดแดงแข็ง (atherosclerosis) และโรคการสะสมไขมัน (lipid storage diseases) นอกจากนี้ ACAT-IN-3 ยังถูกนำมาใช้ในการค้นคว้าพัฒนายาเพื่อสร้างยารักษาสำหรับจัดการภาวะคอเลสเตอรอลในเลือดสูง (hypercholesterolemia) และโรคหัวใจหลอดเลือดที่เกี่ยวข้อง การประยุกต์ใช้ครอบคลุมการทดลองในหลอดทดลอง (in vitro) และในสิ่งมีชีวิต (in vivo) เพื่อประเมินประสิทธิภาพและผลข้างเคียงที่เป็นไปได้ในการปรับสมดุลโฮเมโอสแตติกของคอเลสเตอรอล