PF-543 hydrochloride ใช้ในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์ sphingosine kinase 1 (SphK1) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกระบวนการส่งสัญญาณภายในเซลล์และการเจริญเติบโตของเซลล์ โดยเฉพาะในด้านการวิจัยโรคมะเร็ง เนื่องจาก SphK1 มีส่วนเกี่ยวข้องกับการเพิ่มจำนวนและการอยู่รอดของเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อเข้าใจบทบาทของ SphK1 ในการอักเสบและโรคทางระบบประสาท การใช้สารนี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถระบุเป้าหมายใหม่สำหรับการพัฒนายารักษาโรคได้อย่างมีประสิทธิภาพ