สารประกอบบอโรนไตรฟลูออไรด์อะซีโตไนไตรล์คอมเพล็กซ์เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาอัลคิลเลชันและพอลิเมอไรเซชัน ซึ่งช่วยอำนวยความสะดวกในการก่อตัวของพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าในการผลิตยา พลาสติก และเรซิน ในอุตสาหกรรมยา ใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีพิเศษและเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในงานวิจัยห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยา คุณสมบัติกรดลิวอิสที่แข็งแกร่งทำให้เหมาะสำหรับการกระตุ้นสารตั้งต้นในกระบวนการแปลงสารเคมีต่างๆ