สารคอมเพล็กซ์โบรอนไตรฟลูออไรด์ฟีนอลใช้หลัก ๆ เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในปฏิกิริยาสังเคราะห์อินทรีย์ต่าง ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพสูงในการส่งเสริมกระบวนการพอลิเมอไรเซชัน เช่น การพอลิเมอไรเซชันของโอลฟินและสไตรีน ซึ่งช่วยควบคุมน้ำหนักโมเลกุลและโครงสร้างของพอลิเมอร์ที่ผลิตได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นกรดลิวอิสเพื่ออำนวยความสะดวกในการก่อตัวของโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน ในด้านการผลิตเรซิน สารคอมเพล็กซ์นี้ถูกนำมาใช้เพื่อเสริมกระบวนการบ่มของเรซินอีพ็อกซี่ ซึ่งช่วยปรับปรุงคุณสมบัติทางกลและความเสถียรทางความร้อน ความสามารถในการทำหน้าที่เป็นอิเล็กโทรไฟล์ที่แรงยังทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยา Friedel-Crafts แบบอัลคิลเลชันและอะซิเลชัน ซึ่งสำคัญสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในสารประกอบอะโรมาติก