คอมเพล็กซ์โบรอนไตรบราไมด์ไดเมทิลซัลไฟด์ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับการกำจัดสารป้องกันเมทิลอีเทอร์ (deprotection of methyl ethers) ซึ่งสามารถตัดเมทิลอีเทอร์ได้อย่างมีประสิทธิภาพเพื่อให้ได้แอลกอฮอล์ที่สอดคล้องกัน ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน คอมเพล็กซ์นี้ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบที่มีโบรอน ซึ่งจำเป็นสำหรับกระบวนการเร่งปฏิกิริยาต่างๆ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นกรดลูอิส (Lewis acid) ในปฏิกิริยาที่ต้องการสภาวะอ่อนโยนและควบคุมได้ เช่น การสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งช่วยในการผลิตสารกลางเภสัชภัณฑ์ที่ใช้งานได้ ส่วนประกอบไดเมทิลซัลไฟด์ช่วยเพิ่มความเสถียรและการจัดการของตัวเร่งปฏิกิริยา ทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับการใช้งานในห้องปฏิบัติการและอุตสาหกรรม