ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ฟลูออรีน โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนความเลือกในการจับกับโมเลกุลยาที่มุ่งเป้าไปยังจุดใช้งานของเอนไซม์ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์เพื่อสร้างสารประกอบชีวภาพที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้นและความสามารถในการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตร โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มกิจกรรมและความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม