ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มที่มีเป้าหมายเกี่ยวข้องกับเอนไซม์หรือตัวรับในเซลล์ โครงสร้างที่มีพิเพอราซีนและพิริมิดีนทำให้มีศักยภาพในการโต้ตอบกับระบบชีวโมเลกุล เช่น ใช้พัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง หรือยาต้านมะเร็งในระยะวิจัย นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) และปรับแต่งคุณสมบัติของโมเลกุลให้มีประสิทธิภาพและจำเพาะมากขึ้น