ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่เป็นสารตั้งต้นในการพัฒนายา โดยเฉพาะในกลุ่มของยาที่มีโครงสร้างเป็นสารอินทรีย์เชิงซ้อน ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความคงตัวของโมเลกุลและสามารถปรับปรุงคุณสมบัติด้านการดูดซึมและการกระจายตัวในร่างกายได้ นิยมใช้เป็นตัวป้องกันหมู่แอมีน (amine protecting group) ในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน เนื่องจากหมู่ tert-butyl carbamate (Boc) สามารถลบออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ควบคุมปฏิกิริยาได้ง่ายและลดการเกิดผลพลอยได้ที่ไม่ต้องการ นอกจากนี้ยังช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายน้ำของสารตั้งต้นบางชนิดในสภาวะที่เฉพาะเจาะจง