ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาที่มีเป้าหมายในการยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง พบว่าสารประเภทอินดาโซลมีศักยภาพในการออกฤทธิ์เป็นสารต้านการอักเสบ ต้านมะเร็ง หรือยับยั้งการทำงานของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางสัญญาณในเซลล์ โครงสร้างที่มีหมู่ฟูแรนและไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ และปรับปรุงคุณสมบัติด้านเภสัชจลนศาสตร์ เช่น การดูดซึมและการคงอยู่ในกระแสเลือด จึงมีความน่าสนใจในการพัฒนายาใหม่ในระดับแล็บและงานวิจัยก่อนขั้นคลินิก