ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสสำหรับการรักษามะเร็ง เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในสารเคมีเกษตรสำหรับสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารป้องกันเชื้อรา เนื่องจากแกนไพริมิดีนที่เสถียรและกลุ่มฮาโลเจนที่ทำปฏิกิริยาได้ โครงสร้างของสารประกอบช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีเภสัชวิทยาสำหรับปรับปรุงประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสำหรับออกแบบโมเลกุลชีวภาพออกฤทธิ์ใหม่ที่มีคุณสมบัติต้านจุลชีพหรือต้านการอักเสบ