ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรมที่มุ่งเป้าไปยังตัวยับยั้ง kinase โครงสร้างของมันสนับสนุนการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านไวรัส เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับจุดออกฤทธิ์ของเอนไซม์เฉพาะเจาะจง ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) โดยเฉพาะในการปรับปรุงยาที่มีฐาน thienopyrimidine นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพและความจำเพาะสูงขึ้น