ใช้หลักๆ ในงานวิจัยเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายับยั้ง kinase และสารตัวอื่นๆ ที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางอักเสบและมะเร็ง หมู่ฟังก์ชันบรอมโมและเมทอกซี่ช่วยให้สามารถปรับแต่งแบบเลือกสรรผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง ทำให้มีคุณค่าในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างกับกิจกรรมทางชีวภาพ (SAR) นอกจากนี้ยังมีการสำรวจใช้ในการพัฒนายับยั้งตัวรับคานนาบินอยด์ เนื่องจากแกนอินดาโซลมีความสัมพันธ์กับเป้าหมายดังกล่าว ไม่ได้ตั้งใจสำหรับใช้ในอาหาร ผลิตภัณฑ์ผู้บริโภค หรือยารักษาในมนุษย์โดยปราศจากการประเมินความปลอดภัยอย่างละเอียด