ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อนซึ่งพบในโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงยาตัวสมัครที่เล็งเป้าไปที่โรคมะเร็งและโรคอักเสบ หมู่ Boc ที่ป้องกันอะมีนช่วยให้การถอดป้องกันและการปรับแต่งเพิ่มเติมได้อย่างควบคุม สนับสนุนการสังเคราะห์แบบขั้นตอนในลำดับปฏิกิริยาหลายขั้นตอน หมู่ 5-โบรโมไพริไมดิน-2-ิลทำหน้าที่เป็นจุดยึดปฏิกิริยาสำหรับปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเร่งด้วยพัลลาเดียมกับอะมีน แอลกอฮอล์ หรือนิวคลีโอไฟล์อื่นๆ