ใช้เป็นตัวกลางสำคัญ (key intermediate) ในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งไคเนสสำหรับการรักษามะเร็ง ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐาน (building block) ในเคมียารักษาเนื่องจากมีกลุ่มบรอมโมที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม (cross-coupling reactions) ใช้กันทั่วไปในการเตรียมโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่มุ่งเป้าไปยังไคเนสไทโรซีนและระบบเอนไซม์อื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางส่งสัญญาณ (signal transduction pathways) แหวนมอร์โฟลีนช่วยเพิ่มความละลายและความสัมพันธ์ในการจับ ทำให้มีคุณค่ากในการปรับปรุงยาตัวสมัครเพื่อคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ (pharmacokinetic properties) ที่ดีขึ้น