ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้างของมันสนับสนุนการออกแบบสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังตัวรับ tyrosine kinase ซึ่งมีบทบาทในการเจริญเติบโตและการลุกลามของเนื้องอก แกน indolinone ที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มความจำเพาะในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาที่เป็นผู้สมัคร นอกจากนี้ยังมีการสำรวจใช้ในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรมสำหรับความผิดปกติทางระบบประสาทและโรคอักเสบ เนื่องจากคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่เหมาะสม โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ยับยั้งตัวรับที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง เช่น FGFR (Fibroblast Growth Factor Receptor) โครงสร้างของสารนี้ทำให้มีความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้อย่างเฉพาะเจาะจง จึงถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการออกแบบยาที่ต้องการความจำเพาะสูง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาเส้นทางสัญญาณภายในเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งเซลล์และการอยู่รอดของเซลล์