ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับกลไกการขนส่งของสารภายในเซลล์ Apilimod ยับยั้งการทำงานของฟอสโฟอินซิไทด์ 3-คินาส (PIKfyve) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการสร้างและเคลื่อนที่ของถุงนำสาร (vesicles) ภายในเซลล์ ทำให้สามารถใช้ศึกษาผลกระทบต่อกระบวนการต่างๆ เช่น การส่งสัญญาณของเซลล์ การย่อยสลายของสารในไลโซโซม และการตอบสนองต่อการติดเชื้อไวรัสหรือแบคทีเรีย นอกจากนี้ Apilimod ยังอยู่ระหว่างการวิจัยเพื่อประเมินศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ โดยเฉพาะโรคที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกัน เช่น โรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ และโรคอักเสบเรื้อรังบางชนิด เนื่องจากมีผลในการลดการหลั่งของไซโตไคน์ที่ก่อการอักเสบ เช่น IL-12 และ IL-23 จึงอาจช่วยควบคุมการอักเสบที่ผิดปกติได้ ยังมีการศึกษา Apilimod ในการต้านไวรัสบางชนิด เช่น Ebola และ SARS-CoV-2 เนื่องจากไวรัสเหล่านี้ต้องอาศัยกลไกการขนส่งภายในเซลล์ของโฮสต์ในการแพร่พันธุ์ การยับยั้ง PIKfyve จึงอาจช่วยขัดขวางการติดเชื้อในระยะเริ่มต้นได้