ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับกลไกการขนส่งสารภายในเซลล์ Apilimodmesylate มีบทบาทในการยับยั้งการทำงานของฟอสโฟอินซิไทด์ 3-คินาส (PIKfyve) ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการเคลื่อนย้ายของเยื่อหุ้มเซลล์และการสร้างไลโซโซม ทำให้มันถูกนำมาใช้เพื่อศึกษากระบวนการภายในเซลล์ เช่น การสื่อสารระหว่างเซลล์ การย่อยสลายสาร และการตอบสนองต่อสัญญาณจากภายนอก นอกจากนี้ยังมีการวิจัยเกี่ยวกับศักยภาพในการใช้เป็นสารต้านไวรัส โดยเฉพาะไวรัสที่ต้องอาศัยกระบวนการภายในเซลล์โฮสต์ เช่น Ebola และ SARS-CoV-2 เนื่องจากสามารถรบกวนการเข้าสู่เซลล์และการจำลองตัวของไวรัสได้ ในด้านการพัฒนายา สารนี้ถูกพิจารณาเป็นตัวอย่างของโมเลกุลที่สามารถนำไปสู่การออกแบบยารักษาโรคภูมิคุ้มกันบกพร่องหรือโรคอักเสบเรื้อรัง โดยการควบคุมเส้นทางสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบและการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน