บิสอินโดลิลมาลีไมด์ เอ็กซ์ ไฮโดรคลอไรด์ ใช้หลักในการวิจัยทางชีเคมีในฐานะตัวยับยั้งโปรตีนไคเนสซี (PKC) ที่มีประสิทธิภาพสูงและเลือกสรรได้ดี มันถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการศึกษาที่มุ่งเข้าใจบทบาทของ PKC ในเส้นทางการส่งสัญญาณของเซลล์ โดยเฉพาะในกระบวนการเช่นการเพิ่มจำนวนเซลล์ การแยกตัว และการตายของเซลล์ (apoptosis) นักวิจัยใช้สารประกอบนี้เพื่อสืบสวนกลไกที่อยู่เบื้องหลังโรคต่างๆ รวมถึงมะเร็ง โรคหัวใจและหลอดเลือด และภาวะทางระบบประสาท ซึ่งกิจกรรมของ PKC มักจะผิดปกติ นอกจากนี้ มันยังเป็นเครื่องมือที่มีค่ากในการศึกษาทางเภสัชวิทยาเพื่อพัฒนาและทดสอบตัวแทนบำบัดใหม่ที่มุ่งเป้าไปที่เส้นทางที่เกี่ยวข้องกับ PKC ความจำเพาะสูงและประสิทธิภาพทำให้มันเป็นส่วนประกอบที่สำคัญในระบบทดลองเพื่อแยกวิเคราะห์เครือข่ายการส่งสัญญาณที่ซับซ้อนและยืนยันการมีส่วนร่วมของ PKC ในกระบวนการทางชีวภาพเฉพาะ