PD406976 เป็นสารยับยั้ง kinase เฉพาะเจาะจงที่นำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัย โดยเฉพาะการศึกษากลไกการส่งสัญญาณในเซลล์ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการสำรวจบทบาทของเอนไซม์เหล่านี้ในกระบวนการทางชีววิทยาต่างๆ นักวิจัยมักใช้ในการศึกษากลไกที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโต การแยกตัว และการรอดชีวิตของเซลล์ รวมถึงเพื่อทำความเข้าใจถึงผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นในโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การนำไปใช้ในงานทดลองในห้องปฏิบัติการช่วยในการพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายโดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับเส้นทางที่เกี่ยวข้องกับ kinase นอกจากนี้ ยังใช้ในงานคัดกรองประสิทธิภาพสูงเพื่อระบุผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ