Hexachloroacetone ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ รวมถึงยาและผลิตภัณฑ์ทางการเกษตร มีบทบาทในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งช่วยในการป้องกันและควบคุมศัตรูพืชที่ทำลายพืชผล นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างสารเคมีพิเศษและโพลิเมอร์ ในกระบวนการอุตสาหกรรม ใช้เป็นตัวทำละลายหรือสารเคมีในปฏิกิริยาเฉพาะ มีการใช้งานในห้องปฏิบัติการวิจัย สำหรับการศึกษาเชิงทดลองและกระบวนการวิเคราะห์ เนื่องจากมีความตอบสนองสูง จึงต้องจัดการด้วยความระมัดระวังและภายใต้สภาวะที่ควบคุม