ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมี โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายา เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสร้างโครงสร้างของสารที่มีหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถนำไปใช้ต่อในปฏิกิริยาต่างๆ เช่น การสร้างเพปไทด์หรือสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อพัฒนาโมเลกุลที่มีศักยภาพทางเภสัชกรรม โดยหมู่ Boc จะทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนชั่วคราวในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ แล้วสามารถกำจัดออกได้ภายหลังเมื่อต้องการเปิดใช้งานหมู่อะมิโนอีกครั้ง