ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยาต้านฮิสตามีนและยาต้านการอักเสบ โครงสร้างของมัน ซึ่งมีเอสเตอร์เมทิล ฟังก์ชันไดออกโซที่ 1,3 และกลุ่ม 2-ไทอีนิล ช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยสำหรับพัฒนาโมเลกุลชีวภาพใหม่และในการเตรียมวัสดุอินทรีย์ที่มีไทโอเฟน ยังใช้ในการออกแบบสารเคมีพิเศษที่ระบบคอนจูเกตช่วยเพิ่มปฏิกิริยาหรือคุณสมบัติทางแสง ด้วยโครงสร้างที่มีหมู่คาร์บอนิลสามตำแหน่งและวงแหวนไทโอเฟน ทำให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้หลายทาง เช่น การควบแน่น หรือการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งเหมาะสำหรับการสร้างโมเลกุลในห้องปฏิบัติการวิจัยด้านเภสัชกรรมและการพัฒนาสารใหม่