APY29 ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยาในฐานะตัวยับยั้งที่แรงและเลือกสรรต่อเส้นทาง IRE1α-XBP1 เส้นทางนี้เป็นส่วนประกอบสำคัญของการตอบสนองโปรตีนที่พับไม่ถูกต้อง (UPR) ในเซลล์ ซึ่งถูกกระตุ้นภายใต้สภาวะความเครียดของเอนโดพลาสมิกเรติคูลัม (ER stress) โดยการยับยั้ง IRE1α APY29 ช่วยให้นักวิจัยศึกษาบทบาทของเส้นทางนี้ในกระบวนการเซลล์ต่างๆ รวมถึง apoptosis การอักเสบ และ autophagy มีคุณค่าอย่างยิ่งในการทำความเข้าใจกลไกที่อยู่เบื้องหลังโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และเบาหวาน ซึ่ง ER stress และ UPR มีบทบาทสำคัญ นอกจากนี้ APY29 ยังถูกนำมาใช้ในการค้นคว้ายาเพื่อระบุเป้าหมายบำบัดที่เป็นไปได้สำหรับภาวะที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนอง ER stress ที่ผิดปกติ