สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้เป็นหลักในสาขาเคมีทางการแพทย์ในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด การมีวงแหวนไอโซซอกซาโซลและไพรีดีนทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพทางบำบัด นักวิจัยมักใช้มันในการออกแบบและปรับปรุงยาที่มีแนวโน้ม โดยอาศัย reactivity เพื่อนำกลุ่มฟังก์ชันต่างๆ เข้ามาเพื่อเสริมคุณสมบัติทางเภสัชวิทยา นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการเตรียมสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งมีความสำคัญในโปรแกรมค้นพบยาเพื่อระบุการรักษาใหม่สำหรับภาวะทางการแพทย์หลากหลาย เช่น โรคทางระบบประสาท (รวมถึงโรควิตกกังวลหรือโรคซึมเศร้า) และโรคหัวใจและหลอดเลือด