สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักนำไปใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการเตรียมส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และยาที่เป็นผู้สมัคร โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งวงแหวนไอโซซาโซลและกลุ่มเบนซิลออกซี ทำให้เป็นหน่วยก่อสร้างที่หลากหลายในเคมียารักษา โดยเฉพาะในการออกแบบสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและสารเคมีละเอียดอื่นๆ โดยที่ส่วนของไอโซซาโซลเป็นกลุ่มฟังก์ชันหลัก การประยุกต์ใช้งานยังครอบคลุมถึงการวิจัยและพัฒนา ซึ่งทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับการศึกษาปฏิกิริยาเคมีใหม่และเส้นทางเคมี