5-Ethylisoxazol-3-ol ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านแบคทีเรีย ยาต้านเชื้อรา และยาต้านการอักเสบ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังการติดเชื้อจากจุลินทรีย์และภาวะการอักเสบ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติทางยารักษา โครงสร้างวงแหวนไอโซซอกซาโซลของมันมีคุณค่าต่อเคมียารักษาในการออกแบบยาที่มีเสถียรภาพและการดูดซึมทางชีวภาพที่ดีขึ้น