4-Bromo-5-methylisoxazol-3-amine เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม มันมักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยาต้านจุลชีพและยาต้านการอักเสบ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพใหม่ ๆ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารประกอบไอโซซาโซล ซึ่งเป็นกลุ่มสารที่มีศักยภาพในการพัฒนายาชนิดใหม่