ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาปฏิชีวนะ กลุ่ม chloromethyl ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างได้สะดวก ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกสำหรับการค้นพบยา ใช้บ่อยในปฏิกิริยาคัปปลิ้งเพื่อนำหมู่ isoxazole เข้าสู่โมเลกุลขนาดใหญ่ เพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากคุณสมบัติการทำปฏิกิริยาและโครงสร้างที่เหมาะสม