(5-Phenylisoxazol-3-yl)methanol ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และสารประกอบชีวภาพต่างๆ มีบทบาทในการพัฒนายาที่ขัดต่อการอักเสบ การติดเชื้อ และความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างอนุพันธ์ไอโซซอกโซล ซึ่งมีความสำคัญในเคมียารักษาเนื่องจากมีกิจกรรมชีวภาพที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อนสำหรับวัตถุประสงค์การวิจัยและพัฒนา