Donepezil-d7 hydrochloride ถูกใช้เป็นสารอ้างอิงในการวิเคราะห์ทางเภสัชวิทยาและคลินิก โดยเฉพาะในการศึกษาการกระจายตัวและเมแทบอลิซึมของยา donepezil ในร่างกาย เนื่องจากเป็นสารที่ติดฉลากด้วยดิวเทอเรียม ทำให้สามารถแยกแยะและติดตามได้อย่างแม่นยำในตัวอย่างทางชีวภาพ เช่น เลือดหรือปัสสาวะ การใช้สารนี้ช่วยเพิ่มความแม่นยำในการวัดปริมาณยาและผลิตภัณฑ์ที่ได้จากการเผาผลาญ ซึ่งเป็นประโยชน์ในการพัฒนายาและการศึกษาทางคลินิกเกี่ยวกับโรคอัลไซเมอร์