Hexanoic-d11 acid ใช้หลักๆ ในการวิจัยและการประยุกต์ใช้ทางวิเคราะห์ เนื่องจากมีฉลากดิวเทอเรียม (deuterium labeling) โดยทำหน้าที่เป็นสารมาตรฐานภายในในสเปกโทรสโกปีมวลสาร (mass spectrometry) และสเปกโทรสโกปีนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซนานซ์ (NMR spectroscopy) เพื่อการวัดปริมาณและระบุ hexanoic acid และสารประกอบที่เกี่ยวข้องอย่างแม่นยำในส่วนผสมที่ซับซ้อน สารที่มีฉลากนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการศึกษาการเผาผลาญ (metabolic studies) ซึ่งช่วยติดตามเส้นทางชีวเคมีและเข้าใจการเผาผลาญของกรดไขมัน (fatty acids) นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาและตรวจสอบวิธีการวิเคราะห์ (development and validation of analytical methods) เพื่อให้มั่นใจในความถูกต้องและการทำซ้ำได้ในการวิเคราะห์เคมี การใช้ในงานทดลองฉลากไอโซโทป (isotopic labeling experiments) ยังช่วยในการสืบสวนกลไกปฏิกิริยา (reaction mechanisms) และศึกษาการโต้ตอบโมเลกุล (molecular interactions) ในสาขาวิทยาศาสตร์ต่างๆ