L-Lysine-13C6,15N2 Hydrochloride ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยและการวินิจฉัยโรคในฐานะสารที่มีไอโซโทปเสถียรติดฉลาก โดยทำหน้าที่เป็นตัวติดตามในงานศึกษาการเผาผลาญ ช่วยให้นักวิทยาศาสตร์สามารถติดตามการรวมตัวและการใช้ประโยชน์ของไลซีนในระบบชีวภาพได้ รูปแบบที่ติดฉลากนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในงานวิจัยด้านโภชนาการ ซึ่งช่วยให้เข้าใจการเผาผลาญกรดอะมิโน การสังเคราะห์โปรตีน และอัตราการหมุนเวียนในมนุษย์และสัตว์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในโปรตีโอมิกส์ที่ใช้แมสสเปกโทรเมตรีเพื่อเพิ่มความแม่นยำในการวิเคราะห์ปริมาณโปรตีน การประยุกต์ใช้ในวินิจฉัยทางคลินิกช่วยในการศึกษาความผิดปกติของการเผาผลาญและการประเมินการแทรกแซงทางอาหาร