1-Methylxanthine-(methyl-13C,d3) ใช้หลักๆ เป็นสารที่มีฉลากไอโซโทปในงานวิจัยและการศึกษาวิเคราะห์ เป็นสารมาตรฐานภายในที่มีฉลากไอโซโทปเสถียรในสเปกโตรเมตรีมวลสาร ช่วยให้สามารถวัดปริมาณสารอนุพันธ์ methylxanthine ได้อย่างแม่นยำในตัวอย่างชีวภาพ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการศึกษเภสัชจลนศาสตร์เพื่อติดตามการเผาผลาญและการกระจายของ methylxanthines เช่น คาเฟอีนและธีโอฟิลลีน ในร่างกาย การมีฉลากไอโซโทปช่วยให้ตรวจจับได้อย่างถูกต้องและลดการรบกวนจากสารในร่างกาย ทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในการพัฒนายาและการวิจัยทางคลินิก นอกจากนี้ยังช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางการเผาผลาญและผลทาง درمانیที่อาจเกิดขึ้นของยาที่มีพื้นฐานจาก methylxanthine