ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งหลักในการเตรียมอนุพันธ์ไทโอยูเรียและฮีเทอโรไซเคิลที่มีกำมะถันอื่นๆ กลุ่มไอโซไทโอไซยาเนตของมันทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับอะมีนและนิวคลีโอไฟล์อื่นๆ ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารกลางทางเภสัชกรรมและสารเคมีเกษตร เช่น สารกำจัดศัตรูพืชในกลุ่มคาร์บาเมตและยูเรียที่มีฤทธิ์ยับยั้งแมลงและเชื้อรา รวมถึงยาต้านจุลชีพและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์วัสดุฟังก์ชันนอล เช่น เซ็นเซอร์และสีย้อม เนื่องจากโครงสร้างอะโรมาติกและฟังก์ชันที่ทำปฏิกิริยาได้ ในงานวิจัย ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับออกแบบโมเลกุลชีวภาพและศึกษากลไกปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับไอโซไทโอไซยาเนต