ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา หมู่ไอโซไธโอไซยาเนตที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้เกิดการจับคู่ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมอนุพันธ์ไธโอยูเรียและสารประกอบชีวภาพที่มีกำมะถันอื่นๆ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการติดฉลากและการดัดแปลงเนื่องจากความสามารถในการทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรกับอะมีนและไธออล โดยมีโครงสร้างฟีนิลที่มีหมู่บรอมและไตรฟลูออโรมิทิล