ใช้หลักๆ เป็นสารประกอบพื้นฐานเฉพาะทางในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร หมู่ไอโซธิโอไซยาเนตที่ทำปฏิกิริยาได้ดีช่วยให้เกิดการจับคู่กับอะมีนเพื่อสร้างอนุพันธ์ไทโอยูเรีย ซึ่งมีความสำคัญในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ การมีทั้งหมู่โบรมีนและฟลูออรีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์โพรบเรืองแสงและสารประกอบที่มีฉลากสำหรับงานวิจัยชีวเคมี เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนโปรตีนและเปปไทด์ผ่านการจับติดแบบโคเวเลนต์ที่เลือกสรร