Isothiazol-3(2H)-one ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อในระบบน้ำอุตสาหกรรม สี กาว เครื่องสำอาง กระดาษ และสิ่งทอ เนื่องจากมีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ที่แข็งแกร่ง มันยับยั้งการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย เชื้อรา และสาหร่ายได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เหมาะสำหรับการถนอมผลิตภัณฑ์น้ำเพื่อป้องกันการเน่าเสีย มักใช้ในน้ำหอเย็นและน้ำมันทำงานโลหะเพื่อป้องกันการปนเปื้อนจากจุลินทรีย์ที่อาจทำให้เกิดกลิ่นเหม็น การย่อยสลาย และการอุดตันระบบ คุณสมบัติออกฤทธิ์เร็วและครอบคลุมสเปกตรัมกว้างช่วยให้ใช้ในปริมาณน้อย ส่งเสริมประสิทธิภาพต้นทุนและลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม เนื่องจากไม่เสถียรในรูปแบบบริสุทธิ์ จึงมักใช้ในสูตรที่เสถียร เช่น methylisothiazolinone หรือผสมกับสารฆ่าเชื้ออื่นๆ เพื่อยืดอายุการเก็บและประสิทธิภาพ