Benzo[d]isothiazole ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันพบในยาหลายชนิด โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง มันทำหน้าที่เป็นโครงสร้างเฮเทโรไซคลิกในการพัฒนายาต้านโรคจิตและยาต้านจุลินทรีย์ เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และโครงสร้างที่เหมาะสม ระบบวงแหวนนี้ยังปรากฏในสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและการดูดซึมทางชีวภาพของยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชบางชนิด นอกจากนี้ สารอนุพันธ์ของ benzo[d]isothiazole ยังถูกสำรวจในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการใช้ในเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และสีย้อมเรืองแสง เนื่องจากระบบคอนจูเกตและคุณสมบัติการขนส่งอิเล็กตรอน