ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร 3-bromoisothiazole ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรม เนื่องจากมีอะตอมโบรมีนที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม โครงสร้างของมันมีคุณค่าต่อการพัฒนาสารกำจัดเชื้อราและสารฆ่าเชื้อแบคทีเรีย โดยเฉพาะในสภาพแวดล้อมอุตสาหกรรมและการเกษตรที่การควบคุมจุลินทรีย์เป็นสิ่งสำคัญ สารนี้ยังถูกใช้ในการวิจัยเพื่อออกแบบสารประกอบขึ้นอยู่กับ isothiazole ใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาหรือกำจัดศัตรูพืช