ไอโซไธอะโซล-4-คาร์บอนิไทรล์ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกต่างๆ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพ สารต้านเชื้อรา หรือสารต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตร เพื่อพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ๆ กลุ่มไนไตรล์ของสารนี้ยังทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการผลิตสีย้อม สารให้สี และสารเคมีพิเศษอื่นๆ ความตอบสนองและกลุ่มฟังก์ชันของมันช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาเคมีหลากหลาย ทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในห้องปฏิบัติการอุตสาหกรรมและวิจัย