5-AMINOISOQUINOLINE DIHYDROCHLORIDE ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาคุณสมบัติทางชีวภาพและศักยภาพในการเป็นยารักษาโรค โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านอนุมูลอิสระและสารยับยั้งเอนไซม์ ซึ่งช่วยในการค้นพบยาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงและมีผลข้างเคียงน้อยลง