7-Chloroisoquinolin-4-amine ใช้หลักในงานวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการพัฒนายาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์และโรคพาร์กินสัน นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจบทบาทของมันในการสร้างยาต้านการอักเสบและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับเอนไซม์และตัวรับเฉพาะเจาะจง นักวิจัยยังศึกษาคุณประโยชน์ของมันในการออกแบบยาปฏิชีวนะชนิดใหม่เพื่อต่อสู้กับเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อยา ความหลากหลายในการใช้ในเคมียารักษาโรคทำให้เป็นสารประกอบที่มีความสำคัญต่อการค้นคว้าและพัฒนายา