8-Bromo-7-fluoroisoquinoline ใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยสารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ตัวยับยั้งสำหรับเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาโพรบเรืองแสงสำหรับการถ่ายภาพและการวินิจฉัย โดยอาศัยคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์เพื่อเพิ่มความไวในการตรวจจับ ประโยชน์ของมันยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งช่วยในการออกแบบวัสดุอินทรียขั้นสูงที่มีลักษณะทางอิเล็กทรอนิกส์หรือทางแสงเฉพาะ