ใช้ในสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีโครงสร้างไอโซควิโนลีน หมู่ฟังก์ชันบรอโมและเอสเตอร์ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาครอสคัปพลิงและการแทนที่นิวคลีโอไฟล์ได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน นิยมใช้ในเคมีเภสัชวิทยาสำหรับการเตรียมสารที่มีศักยภาพเป็นยาต้านมะเร็ง ยาต้านจุลชีพ และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนาสารยับยั้งคินาเสและลิแกนด์ตัวรับใหม่ เนื่องจากโครงสร้างไอโซควิโนลีนมีความสัมพันธ์กับเป้าหมายทางชีวภาพ