ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในเภสัชกรรมและเกษตรเคมี หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับอะมีนและแอลกอฮอล์ ทำให้มีคุณค่าในการนำหมู่ไอโซควิโนลีนเข้าไปในโมเลกุลขนาดใหญ่ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายับยั้งไคเนสและยารักษาอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปยังมะเร็งและโรคอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสำหรับการติดฉลากและการดัดแปลงชีวโมเลกุล เนื่องจากมีคุณสมบัติปฏิกิริยาที่ตอบสนองได้ดีและความเสถียรของโครงสร้างอะโรมาติก