ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทและโรคมะเร็ง สารอนุพันธ์ของ 7-ฟลูออร์ไอโซควิโนลีนสามารถทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งเอนไซม์บางชนิด เช่น เอนไซม์ฟอสโฟไรเลชั่น ซึ่งเกี่ยวข้องกับเส้นทางสัญญาณของเซลล์ ทำให้มีศักยภาพในการพัฒนาเป็นยารักษาโรคเรื้อรัง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบห่วงใหม่ที่มีโครงสร้างซับซ้อนสำหรับทดสอบกิจกรรมทางชีวภาพ