ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชศาสตร์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะสารตั้งต้นสำหรับสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อน ฟังก์ชันอัลไคน์ของมันช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาคลิกเคมี เช่น การไซโคลอะดิชันอะซายด์-อัลไคน์ที่เร่งด้วยทองแดง (CuAAC) ซึ่งช่วยให้การประกอบโมเลกุลที่มีประสิทธิภาพ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ รวมถึงสารยับยั้งคินาสที่มีศักยภาพและสารต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นลิแกนด์หรือสารกลางในงานเร่งปฏิกิริยาและเคมีเวชศาสตร์ เนื่องจากโครงสร้างไอโซควิโนลีนที่แข็งและโปรไฟล์การตอบสนอง