ใช้ในงานวิจัยเภสัชภัณฑ์เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความจำเพาะในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้มีคุณค่าในการปรับปรุงยาตัวสมัครเพื่อประสิทธิภาพและเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น นอกจากนี้ยังมีการสำรวจในด้านเคมีเกษตรสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงและความปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อม