ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกเฉพาะได้ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมต้านมะเร็ง ต้านไวรัส หรือต้านการอักเสบ ปกติใช้ในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้งเพื่อนำแกนไอโซควิโนลีนเข้าสู่โมเลกุลยาขนาดใหญ่ นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากความเสถียรและปฏิกิริยาที่เกิดจากกลุ่มไตรฟลูออโรมีทิลและคลอโร